نشانه‌هایی از نقش فعال‌تر مجتبی خامنه‌ای در اداره امور جمهوری اسلامی وجود دارد.

مارکو روبیو، وزیر خارجه آمریکا، در جلسه‌ای در سنای این کشور گفت شواهدی وجود دارد که نشان می‌دهد مجتبی خامنه‌ای پس از تحولات اخیر، به‌طور فزاینده‌ای در روند اداره امور جمهوری اسلامی نقش گرفته است.

او مدعی شد با توجه به عدم حضور علنی برخی مقامات ارشد، تصمیم‌گیری‌ها بیشتر از طریق واسطه‌ها و مکاتبات انجام می‌شود و بخشی از ارتباطات نیز به‌صورت غیرمستقیم دنبال می‌شود.

روبیو همچنین گفت ارزیابی‌های آمریکا نشان می‌دهد میزان درگیری او در امور حکومتی به‌تدریج افزایش یافته، هرچند جزئیات این تماس‌ها عمدتاً محرمانه و غیرعلنی است.